La libération virale dans la salive peut persister jusqu'à 7 semaines après la résolution de la stomatite. Les patients présentant des lésions génitales primaires sont généralement infectieux pendant 7 à 10 jours. Pour les individus atteints d'une maladie récurrente, la période de contagiosité dure généralement 4 à 7 jours lors de chaque épisode.