Les médicaments utilisés dans le traitement de l'otite moyenne sont principalement prescrits pour soulager la douleur et contrôler l'infection. Pour la gestion de la douleur, des analgésiques en vente libre tels que le paracétamol ou l'ibuprofène peuvent être utilisés. En l'absence de perforation ou de déchirure du tympan, des gouttes auriculaires anesthésiques locales peuvent aider à soulager la douleur. Pour le traitement de l'infection, les antibiotiques administrés par voie orale ou sous forme de gouttes auriculaires sont essentiels. Des gouttes préparées spécialement en pharmacie peuvent également être incluses dans le traitement. L'efficacité des décongestionnants pour la congestion nasale et des antihistaminiques pour les allergies dans le traitement de l'otite moyenne n'est pas scientifiquement prouvée et n'est généralement pas recommandée.