Los endometriomas, a menudo conocidos como quistes de chocolate, no suelen resolverse espontáneamente. El enfoque de tratamiento más efectivo es la extirpación quirúrgica. Aunque ciertos medicamentos pueden ayudar a manejar los síntomas y ralentizar el crecimiento del quiste, generalmente no eliminan los quistes. En los casos en que un quiste se rompe, su contenido puede derramarse en la cavidad abdominal. Sin embargo, si la pared del quiste no se extirpa por completo, el riesgo de recurrencia sigue siendo significativamente alto.