La colitis ulcerosa no tratada o insuficientemente controlada aumenta el riesgo de cáncer de colon. Además, la colitis ulcerosa puede dar lugar a las siguientes complicaciones graves o manifestaciones extraintestinales:
* Engrosamiento y estrechamiento de la pared intestinal (formación de estenosis)
* Perforación del colon
* Hemorragia intestinal grave
* Deshidratación severa
* Sepsis (infección sanguínea)
* Raramente, disfunción hepática o enfermedades de las vías biliares
* Riesgo de tromboembolia (coágulos sanguíneos)
* Inflamaciones articulares como espondilitis y sacroileítis