El procedimiento de colonoscopia en sí mismo suele durar entre 20 minutos y 1 hora. Los pacientes pueden requerir de 1 a 2 horas adicionales de observación para recuperarse completamente de los efectos de la sedación administrada para asegurar un procedimiento cómodo. Además, los gases y la hinchazón causados por el aire introducido en los intestinos para obtener imágenes claras suelen desaparecer en 1 o 2 días.