El sistema de neuronavegación se utiliza principalmente en los siguientes procedimientos quirúrgicos dentro de la Neurocirugía (Cirugía del Cerebro, Nervios y Médula Espinal):

* Cirugías de tumores cerebrales
* Cirugías para hemorragias intracraneales
* Tratamiento quirúrgico de enfermedades cerebrovasculares, como las malformaciones arteriovenosas (MAV)
* Cirugías de Estimulación Cerebral Profunda (DBS) para la enfermedad de Parkinson y condiciones similares relacionadas con temblores
* Cirugías de columna vertebral y colocación precisa de implantes (tornillos, varillas, etc.) en la columna
Además, el sistema de neuronavegación también puede emplearse en ciertos procedimientos quirúrgicos ortopédicos.