Durante el tratamiento PUVA pueden presentarse diversos efectos secundarios potenciales. Estos generalmente se pueden agrupar de la siguiente manera:

* Efectos secundarios generales y a corto plazo: Picazón en la piel, dolor de cabeza, náuseas, vómitos.
* Efectos secundarios observables en tratamientos a largo plazo: Sequedad de la piel, manchas, oscurecimiento del tono de la piel, pecas y envejecimiento cutáneo.
* Otros efectos secundarios: Elevación de las enzimas hepáticas y la activación de infecciones herpéticas en algunas personas.