La causa exacta de la enfermedad de Kawasaki aún no se comprende completamente. Aunque se cree que las infecciones pueden desencadenar la enfermedad, no existe un método directo de prevención específico para la enfermedad de Kawasaki. No obstante, ciertas medidas generales son cruciales para proteger la salud general de los niños y aumentar su resistencia a las infecciones. Estas medidas incluyen prácticas de higiene regulares, un estilo de vida que apoye un sistema inmunológico fuerte, chequeos de salud pediátricos periódicos y la vacunación completa de todas las vacunas infantiles.