Darmparasiten werden im Allgemeinen in zwei Hauptkategorien unterteilt: Protozoen und Helminthen.

Protozoen: Dies sind mikroskopisch kleine, einzellige Organismen. Häufig vorkommende Protozoenarten, die beim Menschen Darminfektionen verursachen, sind Giardia lamblia, Entamoeba histolytica, Cryptosporidium und Cyclospora cayetanensis. Diese Parasiten verbreiten sich typischerweise über kontaminierte Lebensmittel, Wasser, Boden oder Oberflächen, die mit menschlichem und tierischem Kot verunreinigt sind. Zum Beispiel können sie in schlecht gewarteten Thermalbädern oder Schwimmbädern gefunden werden. Einige Protozoen bilden widerstandsfähige Zysten, die außerhalb des Wirts monatelang überleben können. Das Verschlucken dieser mikroskopischen Zysten oder Parasiten führt zu einer Infektion.

Helminthen: Dies sind mehrzellige Darmwürmer, die mit bloßem Auge sichtbar sind. Helminthen werden im Allgemeinen als Plattwürmer (Trematoden und Zestoden) und Rundwürmer (Nematoden) klassifiziert. Die Gruppe der Plattwürmer umfasst Bandwürmer, während die Rundwürmer viele Arten, einschließlich Madenwürmer, umfassen. Insbesondere Madenwürmer (Enterobius vermicularis) gehören zu den häufigsten Darmhelminth-Infektionen beim Menschen, insbesondere bei Kindern.