Die Kapselendoskopie wird in der Regel bei erwachsenen Patienten angewendet. Obwohl sie technisch bei Patienten jeden Alters durchgeführt werden kann, ist sie aufgrund von Schluckbeschwerden möglicherweise nicht für sehr alte Personen und sehr kleine Kinder geeignet. Die Literatur berichtet über ihre Anwendung in einem breiten Altersbereich, von 8-10 Monate alten Säuglingen bis zu 85-jährigen Patienten. Bei Patienten dieser extremen Altersgruppen müssen jedoch die potenziellen Vorteile des Verfahrens sorgfältig abgewogen und eine umfassende Vorabklärung vorgenommen werden.