Das Neuronavigationssystem wird vor allem in der Neurochirurgie bei folgenden Eingriffen eingesetzt:

Operationen bei Hirntumoren
Hirnblutungen
AVM (Arteriovenöse Malformation)-Operationen
Operationen bei Parkinson und ähnlichen Krankheiten mit Tremor, die die Implantation eines Hirnschrittmachers erfordern
Wirbelsäulenoperationen und zur Bestimmung der Richtung von Wirbelsäulenimplantaten
Darüber hinaus findet das Neuronavigationssystem auch in einigen orthopädischen Operationen Anwendung.