Während des EMG-Verfahrens werden dem Körper harmlose, niederfrequente elektrische Reize zugeführt. Diese Reize verursachen im Allgemeinen keine Schmerzen. Das Ausmaß der Beschwerden, die durch die in die Muskeln eingeführten sterilen Einweg-Nadelelektroden verursacht werden, ist ebenfalls typischerweise sehr gering. Selten können an den Nadeleinstichstellen kleine subkutane Blutungen oder leichte Blutergüsse auftreten.