Kalp kapak hastalıklarının çeşitli nedenleri bulunmaktadır. Birincil olarak, doğuştan gelen kapak anomalileri bazı bireylerde zamanla aort darlığı veya yetmezliği gibi komplikasyonlara yol açabilir; bu bireylerde kapak enfeksiyonu riski de artmıştır. İkincil olarak, romatizmal ateş, mitral kapak prolapsusu, kapak kireçlenmesi ve edinilmiş kapak enfeksiyonları gibi faktörler de kalp kapak hastalıklarının gelişimine katkıda bulunabilir.