Penis kanseri ile ilişkili başlıca risk faktörleri şunlardır:

* Sünnetsiz Olmak: Sünnet olmamış erkeklerde penis kanseri riski, sünnetli erkeklere kıyasla daha yüksektir. Yenidoğan sünneti, bu riski önemli ölçüde azaltabilir.
* Yaş: Penis kanseri vakalarının çoğu 50-70 yaş arasındaki erkeklerde görülmekle birlikte, vakaların yaklaşık üçte biri 50 yaşın altındadır.
* Sigara ve Tütün Kullanımı: Tütün ürünlerinin kullanımı, penis kanseri riskini artırır.
* İnsan Papilloma Virüsü (HPV) Enfeksiyonu: Özellikle HPV 16 ve HPV 18 türleri, penis kanseri gelişimi ile güçlü bir şekilde ilişkilendirilmiştir.
* Fimozis: Sünnet derisinin geri çekilememesi durumudur. Bu durum, hijyen sorunlarına yol açarak smegma, bakteri ve diğer kalıntıların birikmesine neden olabilir ve riski artırır.
* Sedef Hastalığı Tedavisinde UV Işık Kullanımı: Sedef hastalığı gibi bazı cilt rahatsızlıklarının tedavisinde uygulanan UV ışık terapileri, penis kanseri riskini yükseltebilir.
* Edinilmiş Bağışıklık Eksikliği Sendromu (AIDS): Bağışıklık sistemi zayıflığı, penis kanseri riskini artırabilir.