Rektum kanserinin tedavisinde cerrahi müdahale temel ve sıklıkla uygulanan bir yöntemdir. Cerrahi seçenekler, tümörün konumuna ve evresine bağlı olarak sfinkter koruyucu rezeksiyonlar veya kalıcı stoma gerektirebilecek rezeksiyonlar (örn. abdominoperineal rezeksiyon) şeklinde çeşitlilik gösterir. Kanserin evresine göre kemoterapi ve radyoterapi de tedavi protokolünün önemli bileşenleridir. Özellikle evre 2 ve 3 rektum kanserinde, bu tedaviler tümörü küçültmek (neoadjuvan tedavi) ve hastalığın nüks riskini azaltmak (adjuvan tedavi) amacıyla uygulanmaktadır.