Anizokori, göz içinde veya kafada oluşan lezyonlar, migren ve tümörler nedeniyle ortaya çıkar. Bunun yanı sıra birçok sağlık problemi, yaralanma veya ilaç yan etkileri de anizokoriye neden olabilir. Anizokorinin fizyolojik veya patolojik olabilecek nedenleri şunlardır:

* Migren tipi şiddetli baş ağrıları
* Ameliyat sonrası yan etkiler
* Göz damlaları veya bazı ilaçlar
* Sinir sistemindeki bir bozukluk sonucu oluşan Horner sendromu
* Sinir felci
* Göz veya baş travmaları
* Glokom (göz tansiyonu)
* Gözün iç kısmındaki iltihaplanmalar
* Beyin anevrizmaları
* Darbeler ve travmalar
* Beyin tümörleri
* Bazı kanser türleri

Anizokorinin altında yatan nedeni belirlemek için değerlendirme yapılması gereklidir. Tedavi, altta yatan duruma bağlı olarak değişir ve duruma özel olarak planlanır.