Proloterapi, her hasta için uygun bir tedavi seçeneği olmayabilir. Özellikle belirli kronik rahatsızlıkları bulunan kişilerde, tedavinin etkinliği sınırlı kalabilir veya bazı riskler barındırabilir. Bu tür durumlarda, hekim hastanın genel sağlık durumu ve ihtiyaçları doğrultusunda alternatif tedavi yöntemleri önerecektir.