Karaciğer kanserinin ilk tedavi yöntemi, tümörün cerrahi olarak alınmasıdır. Bu mümkün değilse, karaciğer nakli değerlendirilir. Lokal tedavi seçenekleri arasında ablasyon, embolizasyon, radyasyon tedavisi, hedefli ilaç tedavisi, immünoterapi, kriyoterapi ve kemoterapi bulunur; bu yöntemler kanser hücrelerini yakarak veya dondurarak yok etmeyi amaçlar.

Cerrahi müdahalenin uygunluğu, tümörün evresine, yayılımına ve hastanın mevcut karaciğer hastalığının şiddetine bağlıdır. Kanser metastaz yapmışsa, yani karaciğer dışına yayılmışsa, cerrahi tedavi mümkün değildir.

En ideal tedavi karaciğer naklidir. Bu işlemde hastalıklı karaciğer tamamen çıkarılıp yerine sağlıklı bir karaciğer yerleştirilir. Nakil sonrası tümörün tekrarlama riski daha düşüktür.