Karaciğer biyopsisi başlıca üç ana türe ayrılır: perkütan, transjuguler ve cerrahi biyopsi. Perkütan karaciğer biyopsisinde, karaciğer dokusundan örnek almak için cilt üzerinden bir iğne kullanılır. Bu yöntem, uzun yıllardır yaygın olarak uygulanan standart bir prosedürdür. Hastanın durumuna bağlı olarak, işlem öncesinde veya sırasında ultrasonografi (USG) veya Bilgisayarlı Tomografi (BT) gibi görüntüleme yöntemleri kılavuzluk amacıyla kullanılabilir. Transjuguler biyopsi ise boyundaki juguler vene bir iğne ile girilerek, buradan damarlar yoluyla karaciğere ulaşıp örnek alınmasıdır. Özellikle karın boşluğunda sıvı birikimi (asit) olan hastalarda perkütan biyopsi yerine tercih edilir. Cerrahi biyopsi ise, hastanın başka bir cerrahi operasyon (örneğin safra kesesi ameliyatı) geçirdiği durumlarda, genel cerrahi uzmanı tarafından ihtiyaç duyulması halinde karaciğerden örnek alınmasıdır.