Kara mantar (mukormikoz) hastalığının ileri evrelerinde cerrahi müdahale gerekebilir. Bu, hastalığın neden olduğu ağır hasarlı doku ve organların (burun, akciğer, göz gibi) cerrahi olarak çıkarılmasını içerebilir. Ameliyatın temel amacı, enfeksiyonun vücudun diğer bölgelerine yayılmasını engellemektir.