Kapsül endoskopi işlemi genellikle erişkinlere uygulanır. Teknik olarak her yaş grubuna uygulanabilir olsa da, yutma güçlüğü nedeniyle çok küçük ve çok yaşlı hastalar için uygun olmayabilir. Literatürde 8-10 aylık bebeklerden 85 yaşına kadar olan hastalara uygulandığı bildirilmiş olmakla birlikte, bu yaş gruplarında işlemden beklenen faydaların çok iyi belirlenmesi ve detaylı bir değerlendirme yapılması şarttır.