Endoskopi işlemleri, hastanın konforunu ve rahatlığını sağlamak amacıyla genellikle boğazı uyuşturmak için lokal anestezi veya damardan sedasyon ilaçları ile gerçekleştirilir. Özel bir tıbbi durum olmadığı sürece, işlem yaklaşık 10 dakika süren hızlı bir uygulamadır ve ağrı veya önemli bir rahatsızlık hissi vermeden tamamlanır.