MR çekimi, ciddi klostrofobisi nedeniyle cihaza girmeyi reddeden hastalara uygulanmamaktadır. Böbrek yetmezliği bulunan hastaların kan tahlillerinde üre ve kreatinin değerleri belirli bir düzeyin üzerindeyse, işlem öncesinde hekim tarafından değerlendirilmeleri zorunludur. Genel MR güvenlik kuralları kardiyak MR prosedürleri için de geçerlidir. Hastanın vücudunda MR uyumlu olmayan metal protez, kalp pili veya herhangi bir elektronik implant bulunması durumunda çekim önerilmez. Kalp pilleri veya metal kapakçıklar mevcut ise, bunların MR uyumlu olması gerekmektedir. İşlemden önce hastaya vücudunda metal protez, kalp pili, metal kapakçık veya başka herhangi bir metal implant olup olmadığı mutlaka sorulmalı; piercing gibi tüm metal objeler çıkarılmalıdır.