El, ayak ve ağız hastalığı (HFMD), genellikle koksakivirüs gibi enterovirüslerin neden olduğu bulaşıcı bir döküntülü hastalıktır. Hastalık şüphesi olan çocuklarda pediatri uzmanı, detaylı bir anamnez (tıbbi öykü) alır ve ardından kapsamlı bir fiziksel muayene yapar. Bu muayene sırasında tipik bulgulara dayanarak ön tanı konulabilir. Ancak kesin tanı için boğaz sürüntüsü, dışkı veya kan örneği alınarak laboratuvar testleri yapılabilir. Tanı, klinik bulgular ve laboratuvar test sonuçlarının birleşimiyle kesinleşir.