Tüberküloz tedavisi, birden fazla ilacın kullanımı söz konusu olduğundan, çeşitli yan etkilere neden olabilir. Bu yan etkiler kişiden kişiye önemli ölçüde farklılık gösterebilir. Yaygın yan etkiler arasında deri döküntüleri, mide bulantısı, ciltte kaşıntı, sarılık ve idrar renginde koyulaşma bulunabilir.