Trakea cerrahisi, soluk borusunda doğuştan gelen veya sonradan gelişen iyi huylu (benign) ve kötü huylu (malign) tüm hastalıklarda endikedir. Buna ek olarak, trakeal darlık (trakeostanoz) ve trakeal yaralanmalar gibi durumlar da trakea cerrahisi ile tedavi edilebilir.