Karaciğer biyopsisi, hafif sedasyon eşliğinde yapıldığında genellikle ağrısız bir işlemdir. İşlem sonrasında, biyopsi uygulanan bölgede ve sağ omuzda hafif ağrı hissedilebilir. Bu tür ağrılar genellikle hafiftir ve basit ağrı kesicilerle kontrol altına alınarak birkaç gün içinde tamamen kaybolur.