Endometriozis genellikle belirgin semptomlarla kendini gösterir. Bunlar arasında adet dönemlerinde kötüleşen kronik pelvik ağrı, idrar yaparken veya dışkılarken ağrı, cinsel ilişki sırasında ağrı, idrar veya dışkıda kan görülmesi yer alır. Bazı vakalarda ishal veya kabızlık da görülebilir. Şiddetli endometriozis vakalarında ise kısırlık önemli bir sorun teşkil edebilir.