Karaciğer kanseri prognozu, hastalığın evresine ve tedavi seçeneklerine göre farklılık gösterir. Ne yazık ki, ileri evre veya tedavi edilemeyen vakalarda ortalama yaşam beklentisi genellikle 6-9 ay kadardır. Tedavideki en etkili yaklaşımlardan biri, uygun vakalarda tümörün cerrahi olarak çıkarılmasıdır. Cerrahiye uygunluk, tümörün evresi, yayılım durumu ve hastanın altta yatan karaciğer hastalığının derecesi gibi kritik faktörlere bağlıdır.