Одной из основных технических сложностей в эндоскопической хирургии уха является то, что хирург должен манипулировать эндоскопом одной рукой для обеспечения поля зрения, выполняя при этом хирургическую процедуру другой рукой. Однако это, как правило, не представляет существенного недостатка для хирургов, имеющих опыт в эндоскопической хирургии уха. Что касается визуализации, микроскопическая хирургия предлагает трехмерное восприятие глубины, в то время как эндоскопическая хирургия, хотя и обеспечивает широкое и четкое поле зрения, дает двухмерное изображение. Тем не менее, маневренность эндоскопа во время операции может дать хирургу ощущение трехмерной глубины.