Botox-Behandlung, die die Muskelkontraktion hemmt, kann bei Achalasie angewendet werden. Da die Wirkung der Botox-Injektion jedoch kurzlebig ist, bietet sie keine dauerhafte Lösung und muss ständig wiederholt werden. Diese wiederholten Anwendungen können zur Entwicklung fibrotischer Gewebe im unteren Ösophagusbereich führen. Daher ist sie nicht die bevorzugte Behandlungsmethode.