Kalp içindeki pıhtı veya enfeksiyonları araştırmak, kalp kapakçıklarının işlevini değerlendirmek, aort yırtılmalarını teşhis etmek, kalp deliklerini incelemek, kalp yetmezliğinin durumunu belirlemek ve kalp kapakçığı ameliyatları veya kalp delikleri ameliyatlarının başarısını değerlendirmek için kullanılan bir yöntemdir. Ayrıca, doğuştan kalp hastalıklarının teşhis ve tedavi takibinde de kullanılır. TEE, kalp için faydalı bir inceleme yöntemidir.