Применение ботокса может быть использовано в качестве временного варианта лечения ахалазии благодаря его способности ингибировать мышечные сокращения. Однако эффект инъекций ботокса кратковременен, не обеспечивает постоянного излечения и требует регулярных повторений. Повторные применения могут привести к развитию фиброзной ткани в нижней части пищевода. Учитывая эти факторы, ботокс обычно не считается основным предпочтительным методом лечения ахалазии.