В то время как расщелина губы в основном представляет собой косметические, губные и носовые проблемы, наиболее значительной проблемой, связанной с расщелиной нёба, является нарушение речи. Сразу после рождения первостепенное значение имеет обеспечение надлежащего питания. На протяжении всего развития у людей с расщелинами может наблюдаться задержка роста зубов, челюсти и костей лица, которая может продолжаться до взрослого возраста. Даже после успешного первоначального восстановления расщелины губы и нёба дети нуждаются в постоянном наблюдении за развитием костей верхней челюсти и зубов в период их роста. Кроме того, корректирующие процедуры, такие как ортогнатические операции (перемещение челюсти) и септоринопластика (операция на носу), часто необходимы в качестве дополнительных методов лечения на более поздних этапах жизни. Когда присутствует только расщелина губы или только расщелина нёба, связанные с этим проблемы, как правило, менее сложны. Однако, когда оба состояния встречаются вместе, процесс заживления и окончательные результаты могут отличаться и иногда представлять большие сложности.