Известного постоянного лечения синдрома PFAPA не существует. Лечение обычно направлено на облегчение симптомов и контроль приступов. Жаропонижающие препараты используются, особенно во время приступов высокой температуры. Такие лекарства, как кортикостероиды (однократная доза) и колхицин, также могут быть полезны для снижения частоты и тяжести приступов. Кроме того, тонзиллэктомия (хирургическое удаление миндалин) считается эффективным хирургическим методом лечения синдрома PFAPA.