Bei einem Patienten mit Durchfall im Rahmen einer Dysenterie wird die Diagnose der Erkrankung und des Erregers anhand der Anamnese, der klinischen Untersuchung und zusätzlicher Laboruntersuchungen gestellt. Die Diagnose des Dysenterie-Erregers kann durch mikroskopische Untersuchung des Stuhls, Stuhlkultur, ELISA oder PCR-Test im Stuhl erfolgen.