A cirurgia de implante coclear é geralmente um procedimento seguro e bem tolerado quando realizado por cirurgiões especialistas em instalações de saúde totalmente equipadas. No entanto, como em qualquer intervenção cirúrgica, certos riscos podem raramente ocorrer. Estes riscos potenciais são tipicamente leves e podem incluir: sangramento, inchaço, infecção no local do implante, zumbido (tinnitus), dormência ao redor da orelha, tontura, alteração do paladar e boca seca. Quando realizado por não especialistas ou em condições inadecuadas, o risco de complicações mais graves, como lesão do nervo facial, vazamento de líquido cefalorraquidiano e meningite, aumenta. Além disso, riscos adicionais podem surgir dependendo do estado de saúde geral e histórico médico do paciente.