Os medicamentos utilizados no tratamento da otite média são prescritos principalmente para aliviar a dor e controlar a infecção. Para o manejo da dor, analgésicos de venda livre como paracetamol ou ibuprofeno podem ser usados. Em casos onde não há perfuração ou ruptura do tímpano, colírios anestésicos locais podem ajudar a aliviar a dor. Para o tratamento da infecção, antibióticos administrados oralmente ou como gotas auriculares são essenciais. Gotas especialmente preparadas em farmácias também podem ser incluídas no tratamento. O benefício de descongestionantes para a congestão nasal e anti-histamínicos para alergias no tratamento da otite média não é cientificamente comprovado e geralmente não é recomendado.