Um dos principais desafios técnicos na cirurgia endoscópica do ouvido é que o cirurgião deve manipular o endoscópio com uma mão para garantir o campo visual, enquanto realiza o procedimento cirúrgico com a outra. No entanto, isso geralmente não representa uma desvantagem significativa para cirurgiões experientes em cirurgia endoscópica do ouvido. Em relação à visualização, embora a cirurgia microscópica ofereça uma percepção de profundidade tridimensional, a cirurgia endoscópica proporciona um campo de visão amplo e claro, ainda que a imagem seja bidimensional. Não obstante, a capacidade de manobra do endoscópio durante a operação pode proporcionar ao cirurgião uma sensação de profundidade tridimensional.