Após o procedimento de coleta, o doador é tipicamente mantido em observação por 24 horas antes da alta. A medula óssea coletada é então processada através de filtros especializados para remover qualquer gordura ou pequenos fragmentos ósseos misturados. Se não for destinada a uso imediato, é criopreservada em soluções especializadas. Quando necessária, é descongelada e administrada ao paciente de forma semelhante a uma transfusão de sangue. Uma vez infundidas, essas células-tronco hematopoéticas migram para a medula óssea do receptor, onde tipicamente começam a produzir novas células sanguíneas dentro de 2-4 semanas.