O tratamento de cross-linking não pode ser aplicado a pacientes com ceratocone em estágio avançado que apresentem cicatrizes (opacidades) ou fissuras significativas na córnea, ou que tenham córneas severamente afinadas. Portanto, o diagnóstico precoce e a intervenção oportuna são de importância crítica para interromper a progressão da doença e avaliar as opções de tratamento adequadas.