Antes do procedimento, os pacientes recebem informações verbais detalhadas e assinam formulários de consentimento por escrito. A área da biópsia é avaliada por ultrassonografia ou tomografia computadorizada (TC). O local do procedimento é então desinfetado com um antisséptico, e um campo estéril é preparado. Anestesia local é administrada para entorpecer a área relevante. Sob orientação de ultrassonografia ou TC em tempo real, uma agulha de biópsia de corte, tipicamente de 1 a 4 mm de diâmetro, é avançada no tecido alvo. Uma vez em posição, o mecanismo de disparo da agulha é ativado, e uma pequena lâmina interna se estende rapidamente para excisar uma amostra de tecido. Esta amostra de tecido é então cuidadosamente colocada em um recipiente contendo um fixador patológico especial. Este processo é repetido várias vezes em diferentes partes da lesão para garantir uma amostragem adequada. O procedimento é concluído após um patologista, presente na sala, confirmar a adequação das amostras coletadas. Este é um procedimento ambulatorial, e sua duração geralmente varia de 15 a 30 minutos.