O sinal clínico mais proeminente da anisocoria é uma pupila ser significativamente maior que a outra. Embora este possa ser o único achado em alguns casos, vários sintomas adicionais podem ser observados dependendo da natureza da causa subjacente ou da progressão da condição. Outros sintomas que podem estar associados à anisocoria incluem:
* Dor ocular
* Visão turva
* Visão dupla (diplopia)
* Sensibilidade à luz (fotofobia)
* Perda súbita de visão
* Dor de cabeça
* Febre
* Náuseas ou vômitos
* Dor ou rigidez no pescoço