O procedimento de cross-linking geralmente oferece uma experiência bastante confortável e é bem tolerado pelos pacientes, graças às gotas oculares anestésicas administradas em intervalos regulares antes e durante o procedimento. No entanto, os pacientes podem sentir sintomas como ardor, picadas, lacrimejamento e dor até que a cicatrização epitelial esteja completa após o procedimento.