Les fistules peuvent être simples ou complexes, et une connaissance approfondie de l'anatomie des fistules complexes est indispensable pour choisir la bonne approche chirurgicale.

L'imagerie par résonance magnétique (IRM) et l'échographie endoanale (EUS) sont les modalités d'imagerie préférées pour déterminer l'anatomie du trajet fistulaire et l'implication des muscles du sphincter anal.