यदि कोलोनोस्कोपी के दौरान पॉलीप्स का पता चलता है, तो उन्हें उसी प्रक्रिया में हटाया जा सकता है। इस प्रक्रिया की औसत अवधि पॉलीप्स की संख्या के आधार पर 30 मिनट से 1 घंटे तक भिन्न हो सकती है।