ऑटोइम्यून रोग ऐसी स्थितियाँ हैं जो तब उत्पन्न होती हैं जब प्रतिरक्षा प्रणाली अपनी स्वस्थ कोशिकाओं और बाहरी आक्रमणकारियों के बीच अंतर करने में विफल रहती है, जिसके परिणामस्वरूप शरीर के अपने ऊतकों और अंगों पर हमला होता है। सामान्यतः, प्रतिरक्षा प्रणाली उन रोगजनकों जैसे वायरस, बैक्टीरिया या कवक को पहचानती है और उनके खिलाफ कार्य करती है जो शरीर को नुकसान पहुँचा सकते हैं। शरीर में प्रत्येक कोशिका झिल्ली में विशिष्ट अणु होते हैं जो प्रतिरक्षा प्रणाली को इसे 'स्वयं का' पहचानने की अनुमति देते हैं। हालांकि, ऑटोइम्यून रोगों में, प्रतिरक्षा प्रणाली गलती से स्वस्थ कोशिकाओं, ऊतकों और अंगों को विदेशी या हानिकारक मानती है, और उनके खिलाफ हमला शुरू कर देती है।