एड्स के उन मामलों में जिनका इलाज नहीं किया जाता है या दवाओं से नियंत्रित नहीं किया जाता है, कमजोर प्रतिरक्षा प्रणाली गंभीर अवसरवादी संक्रमणों या कुछ प्रकार के कैंसर का कारण बन सकती है। ये जटिलताएँ अंततः घातक हो सकती हैं।