FAPI PET/CT प्रक्रिया को आमतौर पर सुरक्षित माना जाता है। संभावित जोखिम आमतौर पर कम होते हैं और इसमें विकिरण के संपर्क में आना, इंजेक्शन स्थल पर प्रतिक्रियाएं और दुर्लभ मामलों में चिंता जैसी स्थितियाँ शामिल हो सकती हैं।