कम्युनिकेटिंग हाइड्रोसील अक्सर एक साल की उम्र तक अपने आप ठीक हो जाते हैं। इसलिए, आमतौर पर एक साल से अधिक उम्र के उन बच्चों के लिए सर्जिकल हस्तक्षेप की योजना बनाई जाती है जिनकी कम्युनिकेटिंग चैनल (पेटेंट प्रोसेसस वजाइनलिस) बंद नहीं हुई होती है। इसके विपरीत, स्पर्मेटिक कॉर्ड सिस्ट का अपने आप ठीक होना दुर्लभ है। संक्रमण के जोखिम और इन्ग्विनल नहर के भीतर की संरचनाओं पर संभावित दबाव के कारण, स्पर्मेटिक कॉर्ड सिस्ट के लिए सर्जिकल सुधार आमतौर पर अनुशंसित है। इन वैकल्पिक प्रक्रियाओं के लिए, आमतौर पर बच्चे के एक साल से अधिक उम्र का होने तक इंतजार करने की सलाह दी जाती है, यह सुनिश्चित करते हुए कि वे सर्जरी के लिए विकासात्मक रूप से तैयार हैं।
स्पर्मेटिक कॉर्ड सिस्ट और हाइड्रोसील दोनों के लिए सर्जिकल प्रक्रिया पेट के निचले हिस्से में, कमर की क्रीज के ठीक ऊपर लगभग 1-2 सेमी के छोटे चीरे से शुरू होती है। इस चीरे के माध्यम से, पेटेंट प्रोसेसस वजाइनलिस (हाइड्रोसील और कॉर्ड सिस्ट से जुड़ा खुला चैनल) की पहचान की जाती है और इसे आसपास की संरचनाओं से सावधानीपूर्वक अलग किया जाता है, जिसमें स्पर्मेटिक कॉर्ड (वास डेफेरेंस और अंडकोष तक जाने वाली रक्त वाहिकाओं सहित) शामिल है। फिर थैली को अवशोषित होने वाले टांके का उपयोग करके इन्ग्विनल नहर के भीतर ऊपर से बांध दिया जाता है, जिससे पेट की गुहा और अंडकोष/कॉर्ड के बीच तरल पदार्थ का संचार प्रभावी ढंग से रुक जाता है। यदि थैली के भीतर कोई अंग पाया जाता है और वह क्षतिग्रस्त नहीं है, तो उसे बांधने से पहले धीरे से पेट की गुहा में वापस कर दिया जाता है। सर्जरी आमतौर पर 30 से 60 मिनट तक चलती है। इसे आमतौर पर डे-केस प्रक्रिया के रूप में किया जाता है, जिससे बच्चे उसी दिन घर लौट सकते हैं और उसके तुरंत बाद अपनी सामान्य गतिविधियों को फिर से शुरू कर सकते हैं। यदि उचित समझा जाता है और पहले से योजना बनाई जाती है, तो एक साथ खतना भी किया जा सकता है।
अंडकोष के चारों ओर तनावग्रस्त गैर-कम्युनिकेटिंग हाइड्रोसील के लिए पहले सर्जिकल हस्तक्षेप पर विचार किया जा सकता है। हालांकि, एब्डोमिनोस्कॉटल हाइड्रोसील का निदान होने पर तुरंत सर्जिकल रूप से प्रबंधन किया जाना चाहिए। यह ध्यान रखना महत्वपूर्ण है कि जन्मजात हाइड्रोसील की सुई से एस्पिरेशन एक खतरनाक तरीका है; इसमें संक्रमण का काफी जोखिम होता है, जिससे बच्चे का अंडकोष खो सकता है।